De Shiatsu beoefenaar zal proberen om de waargenomen energieonevenwichten weg te werken via druk op de meridianen, waarschijnlijk in combinatie met andere technieken, zoals wiegen, strekken en roteren van gewrichten. De beoefenaar zal zich daarbij laten leiden door de initiële diagnose en door de fysieke en visuele feedback die hij krijgt tijdens de behandeling.

De Shiatsu behandeling is holistisch, net als de diagnose. De beoefenaar werkt op het hele lichaam en niet enkel op het gebied waar de klachten het duidelijkst zijn.

Shiatsu werkt het best als de cliënt zo ontspannen en comfortabel mogelijk is. De Shiatsu beoefenaar zal je vragen om je ogen te sluiten, je spieren te ontspannen - als bewegingen nodig zijn, dan zal de beoefenaar het werk wel doen - en niet te praten, tenzij het echt nodig is. Laat het de beoefenaar onmiddellijk weten als je pijn voelt. Anders zal je lichaam zich opspannen en dan gaat het effect van de sessie verloren.